Das Laser-Scanning-Mikroskop (LSM) ermöglicht neben der Standard-Durchlicht-/Auflichtmikroskopie die Bilderzeugung über einen Laserscanner mit 405 nm Wellenlänge. Dadurch können hochauflösende, dreidimensionale Oberflächenbilder mit einer Auflösung von 10 nm in z-Richtung erzeugt werden. Über die Bildbearbeitungssoftware können Mosaik- und Stapel-Aufnahmen sowohl im LSM-Modus als auch in der Lichtmikroskopie realisiert werden. Das Lichtmikroskop mit 6-fach Revolver erstellt mit Hilfe der 5,0 MegaPixel-Kamera Aufnahmen mit maximal 1000-facher Vergrößerung. Der Objekttisch-Steuerung ist motorisiert und so bis auf 1 µm genau reproduzierbar.